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南开大学发表论文解析要害碱性核酸外切酶

时间:2011-11-03     来源:生物通
来自南开大学生命科学学院,香港大学等处的研究人员针对一种要害碱性核酸外切酶,分析了其生化,及生物物理特性,发现了这种酶的要害作用机制,这对于进一步解析DNA重组和修复具有重要意义。这一研究结果宣布在Nucleic Acids Research杂志上。碱性核酸外切酶,以及单链DNA(ssDNA)消化卵白(SSAPs)是许多原核生物,噬菌体,以及病毒状遗传元素中,DNA重组和修复系统的重要组成身分。从近期完成的β-变形菌纲(β-proteobacterium)香港海鸥型菌(Laribacter hongkongensis)HLHK9菌株的基因组序列中,研究人员发现这一3.17Mb巨细的基因组有编码碱性核酸外切酶(LHK-Exo)和SSAP (LHK-Bet) 可能同源异构体。


  为了解析这些要害元素的特性,在这篇文章中,研究人员分析了LHK-Exo重组卵白的生物物理,生物化学,及结构上的特性,并通过结构导向突变分析,探讨了其中差异残基的活性,指出两个守旧性金属离子催化机制也许是这种碱性核酸外切酶的要害所在。


  LHK-Exo能消化线性双链DNA分析,这种外切酶特性需要pH8.2的碱性环境,以及Mg2+或者Mn2+金属离子。研究人员获得了LHK-Exo晶体结构(分辨率1.9),并从中分析LHK-Exo的特性,以及要害作用机制,这对于进一步解析DNA重组和修复具有重要意义。除此之外,南开大学的研究人员还发文论述和探讨了诺罗病毒与Lewis型人类组织血型抗原受体(HBGAs)结合特异性的结构基础与分子机制。这一研究成宣布在PLoS Pathogens杂志上。


  研究人员凭据诺罗病毒VA207衣壳卵白P结构域与Lewis四糖的复合物晶体结构发现,识别四糖的活性位点位于卵白二聚体作用界面的口袋中,卵白和四糖分子之间具有稳定而广泛的氢键网络体系,加入卵白-寡糖相互作用的残基在诺罗病毒家族中具有较高的同源性,且作用模式属于典型的诺罗病毒G-II型基因族的作用模式。突变实验和卵白-寡糖作用检测实验结果证实,加入该作用的氨基酸残基对于病毒与宿主的相互识别作用具有重要意义,对该残基的突变将导致与原来HBGAs寡糖分子结合能力的丧失并使其具有识别新的HBGAs寡糖分子的能力。这项研究通过对诺罗病毒衣壳卵白与lewis寡糖复合物的结构和功效研究,有助于对诺罗病毒与HBGAs的识别作用和侵染宿主提供全面、合理的结构解释,同时为研发抗诺罗病毒药物提供重要的科学依据。

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